Metropolitankirche der Darstellung der Jungfrau Maria
Und doch ist es die dritte Kirche, die an diesem Ort gebaut wurde. Der Grund dafür ist die Metropolitankirche von Rethymnon, auch bekannt als „Megali Panagia“, die sich in der Altstadt befindet und der Darstellung der Jungfrau Maria gewidmet ist. Die erste Kirche wurde während der venezianischen Besatzung gegründet. Während der türkischen Besatzung diente sie auch als Kathedrale, da sie die einzige in der Stadt war, die den Christen für ihre Anbetung zur Verfügung gestellt wurde. Im Jahr 1844 wurde eine neue Kirche, eine dreischiffige Holzbasilika, die der Jungfrau Maria, den drei Hierarchen und den Heiligen Aposteln geweiht war, wieder aufgebaut, aber im Zweiten Weltkrieg von den Deutschen bombardiert. Die moderne Kirche wurde nach dem Krieg nach dem Vorbild der Panagia von Tinos erbaut.
In der südwestlichen Ecke erhebt sich ein Glockenturm mit Türmchen, der 1899 als Antwort auf das hohe Minarett der benachbarten Neraje-Moschee der Muslime errichtet wurde. Das Geld für den Wiederaufbau des Glockenturms wurde von den Weinhändlern der Stadt gespendet. Die Glocke war so groß, dass sie bei dem Versuch, sie auf dem Glockenturm anzubringen, zerbrach. Daher beschloss man, sie nach Venedig zu schicken und acht kleinere Glocken aus demselben Metall anfertigen zu lassen.